Funalgodón cuenta con una Directiva conformada por Textileros Ecuatorianos interesados en el crecimiento global de la producción y la industria nacional.

El Presidente de la Fundación, Ing. Esteban Borja S., que es quien pone rumbo a la embarcación llamada FUNALGODÓN, acorde a los lineamientos dados por la Directiva.

El Director, Ing. Carlos Egüez Álava, quien a su vez toma las directivas del Presidente dando curso al proceso Administrativo diario y normal por medio de las diferentes áreas, esto es:

ASISTENCIA TÉCNICA: Conformada por un cuerpo de técnicos, quienes brindan el control, seguimiento y apoyo a los productores en el campo, a saber: En el sector de Manabí se encuentran Wilber Chinga, Denis Tapia y Byron Macías, para el sector de Pedro Carbo (Guayas) Javier Salazar.

CONTABILIDAD: Carmen Morales, contadora de la Fundación; Tanya Escobar e Irina Medranda.

SISTEMAS: Juan Benítez (Jefe de Sistemas), Gabriela Ponce, Juan Pablo Toala, Andrea Mendoza.

SECRETARIA: Beatriz Chávez (Secretaria General) y Ronal Cedeño (Mensajero)